近日，廣東省科學(xué)院生態(tài)環(huán)境與土壤研究所孫蔚旻研究員團(tuán)隊，自主開發(fā)了分子生物學(xué)新方法（穩(wěn)定同位素示蹤-宏基因組分箱聯(lián)用技術(shù)），并利用該方法在好氧銻氧化基礎(chǔ)研究方面取得了新進(jìn)展。相關(guān)研究成果《Bacteria responsible for antimonite oxidation in antimony-contaminated soil revealed by DNA-SIP coupled to metagenomics》發(fā)表在國際環(huán)境領(lǐng)域權(quán)威期刊《FEMS Microbiology Ecology》。

　　該方法采用室內(nèi)微宇宙培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)，通過對穩(wěn)定同位素示蹤（stable isotope probing，SIP）-宏基因組分箱聯(lián)用技術(shù)進(jìn)行優(yōu)化，將SIP直接與宏基因組測序技術(shù)相結(jié)合，省略了16S rRNA高通量測序步驟；同時，以13C-NaHCO3為唯一碳源，錨定了土壤中驅(qū)動好氧銻氧化過程的自養(yǎng)型功能微生物，揭示了這些功能微生物的代謝途徑，解析了非淹水期銻污染水稻土壤中的好氧銻氧化過程。

　　孫蔚旻自組建團(tuán)隊以來，成功開發(fā)并應(yīng)用分子生物學(xué)新方法（穩(wěn)定同位素示蹤-宏基因組分箱聯(lián)用平臺），積極開展相關(guān)功能微生物類群鑒定和代謝途徑等方面的研究工作，不斷通過技術(shù)方法的創(chuàng)新，進(jìn)一步優(yōu)化完善該技術(shù)平臺的應(yīng)用能力。

SIP-宏基因組測序分析直接聯(lián)用技術(shù)路線圖

　　論文信息：

　　Miaomiao Zhang, Max Kolton, Zhe Li, Hanzhi Lin, Fangbai Li, Guimei Lu, Pin Gao, Xiaoxu Sun, Rui Xu, Fuqing Xu, Weimin Sun，2021. Bacteria responsible for antimonite oxidation in antimony-contaminated soil revealed by DNA-SIP coupled to metagenomics. https://doi.org/10.1021/acs.est.0c01601

　　（省科學(xué)院土壤環(huán)境所土壤生態(tài)修復(fù)團(tuán)隊  張苗苗/供稿）